Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NRF1Q16656 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRF1Q16656 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms