Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CRY1Q16526 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
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