Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
E2F4Q16254 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
E2F4Q16254 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms