Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYTH1Q15438 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTH1Q15438 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms