Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SF3B3Q15393 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SF3B3Q15393 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
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