Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRRQ15256 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRRQ15256 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms