Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 SRSF5-202ENST00000553369 613 ntTSL 210.8□□□□□ -0.688e-20■■■■□ 20.3
NOLC1Q14978 SRSF5-219ENST00000557460 939 ntTSL 59.51□□□□□ -0.898e-20■■■■□ 20.3
NOLC1Q14978 SRSF5-207ENST00000554465 3044 ntTSL 1 (best)9.39□□□□□ -0.918e-20■■■■□ 20.3
NOLC1Q14978 SRSF5-206ENST00000554021 567 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.978e-20■■■■□ 20.3
NOLC1Q14978 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC8.09□□□□□ -1.118e-20■■■■□ 20.3
NOLC1Q14978 COQ8A-206ENST00000479852 1938 ntTSL 1 (best)24.5■■□□□ 1.517e-18■■■■□ 20.3
NOLC1Q14978 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.33■■□□□ 1.011e-323■■■■□ 20.3
NOLC1Q14978 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.051e-323■■■■□ 20.3
NOLC1Q14978 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.612e-10■■■■□ 20.3
NOLC1Q14978 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.542e-10■■■■□ 20.3
NOLC1Q14978 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.452e-10■■■■□ 20.3
NOLC1Q14978 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.422e-10■■■■□ 20.3
NOLC1Q14978 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.392e-10■■■■□ 20.3
NOLC1Q14978 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.352e-10■■■■□ 20.3
NOLC1Q14978 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.32e-10■■■■□ 20.3
NOLC1Q14978 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.252e-10■■■■□ 20.3
NOLC1Q14978 EIF4G1-222ENST00000442406 5129 ntTSL 1 (best)16.34■□□□□ 0.212e-10■■■■□ 20.3
NOLC1Q14978 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.072e-10■■■■□ 20.3
NOLC1Q14978 EMC1-201ENST00000375199 5408 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.381e-6■■■■□ 20.3
NOLC1Q14978 EMC1-207ENST00000477853 6664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.541e-6■■■■□ 20.3
NOLC1Q14978 EMC1-202ENST00000375208 4084 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.681e-6■■■■□ 20.3
NOLC1Q14978 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.874e-7■■■■□ 20.2
NOLC1Q14978 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.564e-7■■■■□ 20.2
NOLC1Q14978 C22orf39-204ENST00000509549 2979 ntTSL 214.01□□□□□ -0.174e-7■■■■□ 20.2
NOLC1Q14978 HIRA-203ENST00000452818 453 ntTSL 512.15□□□□□ -0.464e-7■■■■□ 20.2
NOLC1Q14978 AC069277.1-201ENST00000433639 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.282e-6■■■■□ 20.2
NOLC1Q14978 AC069277.1-204ENST00000342990 246 ntTSL 38.32□□□□□ -1.082e-6■■■■□ 20.2
NOLC1Q14978 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.133e-6■■■■□ 20.1
NOLC1Q14978 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.573e-6■■■■□ 20.1
NOLC1Q14978 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.493e-6■■■■□ 20.1
NOLC1Q14978 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.313e-6■■■■□ 20.1
NOLC1Q14978 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.16■□□□□ 0.56e-70■■■■□ 20.1
NOLC1Q14978 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.26e-70■■■■□ 20.1
NOLC1Q14978 COPA-202ENST00000368069 4664 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.232e-11■■■■□ 20.1
NOLC1Q14978 COPA-201ENST00000241704 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.332e-11■■■■□ 20.1
NOLC1Q14978 MAGED1-207ENST00000482188 680 ntTSL 310.37□□□□□ -0.752e-10■■■■□ 20.1
NOLC1Q14978 MAGED1-205ENST00000470461 810 ntTSL 26.8□□□□□ -1.322e-10■■■■□ 20.1
NOLC1Q14978 SRSF5-208ENST00000554929 947 ntTSL 211.73□□□□□ -0.534e-9■■■■□ 20.1
NOLC1Q14978 SRSF5-216ENST00000556647 644 ntTSL 210.34□□□□□ -0.754e-9■■■■□ 20.1
NOLC1Q14978 EMD-205ENST00000471965 800 ntTSL 224.56■■□□□ 1.523e-6■■■■□ 20
NOLC1Q14978 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.813e-6■■■■□ 20
NOLC1Q14978 GABRE-205ENST00000465405 706 ntTSL 1 (best)9.62□□□□□ -0.873e-6■■■■□ 20
NOLC1Q14978 GABRE-203ENST00000441219 1324 ntTSL 29.53□□□□□ -0.883e-6■■■■□ 20
NOLC1Q14978 THOC2-209ENST00000448128 1365 ntTSL 56.95□□□□□ -1.33e-6■■■■□ 20
NOLC1Q14978 THOC2-217ENST00000492203 641 ntTSL 36.09□□□□□ -1.433e-6■■■■□ 20
NOLC1Q14978 THOC2-208ENST00000441692 4364 ntTSL 54.6□□□□□ -1.673e-6■■■■□ 20
NOLC1Q14978 GABRE-206ENST00000474932 430 ntTSL 54.27□□□□□ -1.733e-6■■■■□ 20
NOLC1Q14978 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.763e-6■■■■□ 20
NOLC1Q14978 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.085e-8■■■■□ 20
NOLC1Q14978 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.035e-8■■■■□ 20
NOLC1Q14978 KDM1A-206ENST00000602503 2810 nt9.51□□□□□ -0.895e-8■■■■□ 20
NOLC1Q14978 PTPRK-217ENST00000524534 2441 ntTSL 513.83□□□□□ -0.22e-6■■■■□ 20
NOLC1Q14978 PABPC1-218ENST00000521865 628 ntTSL 222.78■■□□□ 1.242e-10■■■■□ 19.9
NOLC1Q14978 AC092073.1-201ENST00000592740 625 ntAPPRIS P1 TSL 319■□□□□ 0.634e-25■■■■□ 19.9
NOLC1Q14978 GPI-204ENST00000586392 1706 ntTSL 216.7■□□□□ 0.264e-25■■■■□ 19.9
NOLC1Q14978 GPI-203ENST00000586077 3053 nt13.21□□□□□ -0.294e-25■■■■□ 19.9
NOLC1Q14978 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.282e-11■■■■□ 19.9
NOLC1Q14978 RPL13-206ENST00000472354 631 ntTSL 312.17□□□□□ -0.462e-7■■■■□ 19.9
NOLC1Q14978 SNHG1-225ENST00000545920 625 ntTSL 27.67□□□□□ -1.181e-323■■■■□ 19.8
NOLC1Q14978 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.782e-6■■■■□ 19.8
NOLC1Q14978 ERH-201ENST00000216520 668 ntTSL 315.89■□□□□ 0.132e-8■■■■□ 19.8
NOLC1Q14978 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.092e-8■■■■□ 19.8
NOLC1Q14978 NONO-202ENST00000373841 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.291e-6■■■■□ 19.7
NOLC1Q14978 NONO-215ENST00000535149 2882 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.431e-6■■■■□ 19.7
NOLC1Q14978 NONO-201ENST00000276079 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.561e-6■■■■□ 19.7
NOLC1Q14978 NONO-214ENST00000490044 3215 ntTSL 28.34□□□□□ -1.071e-6■■■■□ 19.7
NOLC1Q14978 SF3B1-209ENST00000479532 587 ntTSL 26.7□□□□□ -1.344e-10■■■■□ 19.7
NOLC1Q14978 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.091e-12■■■■□ 19.7
NOLC1Q14978 SNHG21-202ENST00000558174 725 ntTSL 215.6■□□□□ 0.091e-12■■■■□ 19.7
NOLC1Q14978 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.191e-12■■■■□ 19.7
NOLC1Q14978 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.64□□□□□ -1.511e-12■■■■□ 19.7
NOLC1Q14978 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.35□□□□□ -2.031e-12■■■■□ 19.7
NOLC1Q14978 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.073e-8■■■■□ 19.7
NOLC1Q14978 KIAA1958-201ENST00000337530 11775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.753e-8■■■■□ 19.7
NOLC1Q14978 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.163e-8■■■■□ 19.7
NOLC1Q14978 APOL1-202ENST00000397278 2918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.443e-6■■■■□ 19.6
NOLC1Q14978 APOL1-205ENST00000422706 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.583e-6■■■■□ 19.6
NOLC1Q14978 APOL1-206ENST00000426053 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.633e-6■■■■□ 19.6
NOLC1Q14978 APOL1-203ENST00000397279 1564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.773e-6■■■■□ 19.6
NOLC1Q14978 APOL1-201ENST00000319136 3000 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.773e-6■■■■□ 19.6
NOLC1Q14978 SIRT7-210ENST00000572902 909 ntTSL 323.56■■□□□ 1.362e-8■■■■□ 19.6
NOLC1Q14978 AC134978.1-201ENST00000579480 788 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.582e-9■■■■□ 19.5
NOLC1Q14978 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.13e-8■■■■□ 19.5
NOLC1Q14978 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.74□□□□□ -2.131e-323■■■■□ 19.5
NOLC1Q14978 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC4.45□□□□□ -1.73e-10■■■■□ 19.5
NOLC1Q14978 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.19e-7■■■■□ 19.5
NOLC1Q14978 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.445e-6■■■■□ 19.4
NOLC1Q14978 KLHDC10-202ENST00000463413 503 ntTSL 228.08■■■□□ 2.095e-6■■■■□ 19.4
NOLC1Q14978 NDUFS7-212ENST00000540530 1707 ntTSL 222.37■■□□□ 1.175e-6■■■■□ 19.4
NOLC1Q14978 NDUFS7-213ENST00000543289 3356 ntTSL 221.35■■□□□ 1.015e-6■■■■□ 19.4
NOLC1Q14978 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.955e-6■■■■□ 19.4
NOLC1Q14978 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.895e-6■■■■□ 19.4
NOLC1Q14978 NDUFS7-220ENST00000622587 802 ntTSL 519.92■□□□□ 0.785e-6■■■■□ 19.4
NOLC1Q14978 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.695e-6■■■■□ 19.4
NOLC1Q14978 NDUFS7-215ENST00000546172 869 ntTSL 519.36■□□□□ 0.695e-6■■■■□ 19.4
NOLC1Q14978 ATAD3B-205ENST00000485748 3233 ntTSL 217.32■□□□□ 0.365e-6■■■■□ 19.4
NOLC1Q14978 NDUFS7-214ENST00000545446 3089 ntTSL 217.2■□□□□ 0.345e-6■■■■□ 19.4
NOLC1Q14978 NDUFS7-206ENST00000535382 3050 ntTSL 217.2■□□□□ 0.345e-6■■■■□ 19.4
NOLC1Q14978 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.345e-6■■■■□ 19.4
NOLC1Q14978 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.325e-6■■■■□ 19.4
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