Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEDD9Q14511 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEDD9Q14511 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEDD9Q14511 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
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