Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL9A3Q14050 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
COL9A3Q14050 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
COL9A3Q14050 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL9A3Q14050 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
COL9A3Q14050 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
COL9A3Q14050 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
COL9A3Q14050 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.57■■■□□ 2
COL9A3Q14050 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL9A3Q14050 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL9A3Q14050 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COL9A3Q14050 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL9A3Q14050 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COL9A3Q14050 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COL9A3Q14050 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COL9A3Q14050 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL9A3Q14050 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL9A3Q14050 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL9A3Q14050 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL9A3Q14050 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL9A3Q14050 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL9A3Q14050 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COL9A3Q14050 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL9A3Q14050 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
COL9A3Q14050 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL9A3Q14050 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COL9A3Q14050 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
COL9A3Q14050 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
COL9A3Q14050 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL9A3Q14050 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL9A3Q14050 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL9A3Q14050 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL9A3Q14050 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL9A3Q14050 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.52■■■□□ 2
COL9A3Q14050 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COL9A3Q14050 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
COL9A3Q14050 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL9A3Q14050 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
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