Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK1Q13546 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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