Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRQ13535 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATRQ13535 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATRQ13535 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATRQ13535 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATRQ13535 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATRQ13535 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATRQ13535 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATRQ13535 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATRQ13535 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATRQ13535 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATRQ13535 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATRQ13535 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATRQ13535 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATRQ13535 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRQ13535 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRQ13535 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRQ13535 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRQ13535 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRQ13535 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRQ13535 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRQ13535 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRQ13535 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRQ13535 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRQ13535 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATRQ13535 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATRQ13535 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATRQ13535 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATRQ13535 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATRQ13535 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATRQ13535 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATRQ13535 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRQ13535 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRQ13535 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRQ13535 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRQ13535 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRQ13535 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRQ13535 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRQ13535 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRQ13535 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRQ13535 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRQ13535 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRQ13535 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRQ13535 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRQ13535 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRQ13535 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRQ13535 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRQ13535 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRQ13535 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRQ13535 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRQ13535 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRQ13535 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRQ13535 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRQ13535 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRQ13535 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRQ13535 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRQ13535 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRQ13535 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRQ13535 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRQ13535 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRQ13535 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRQ13535 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRQ13535 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRQ13535 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRQ13535 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRQ13535 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRQ13535 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRQ13535 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRQ13535 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRQ13535 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRQ13535 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRQ13535 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRQ13535 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRQ13535 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRQ13535 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRQ13535 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRQ13535 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRQ13535 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRQ13535 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRQ13535 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRQ13535 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRQ13535 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRQ13535 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRQ13535 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRQ13535 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATRQ13535 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATRQ13535 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATRQ13535 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATRQ13535 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRQ13535 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRQ13535 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRQ13535 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRQ13535 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRQ13535 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRQ13535 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRQ13535 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRQ13535 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRQ13535 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRQ13535 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRQ13535 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms