Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PICALMQ13492 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PICALMQ13492 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PICALMQ13492 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
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