Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
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