Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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