Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PDE3BQ13370 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
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