Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERCC8Q13216 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms