Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3BQ13214 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3BQ13214 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
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