Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHAF1BQ13112 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHAF1BQ13112 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
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