Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK2Q13002 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK2Q13002 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK2Q13002 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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