Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXD4Q12950 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
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