Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX4Q12846 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX4Q12846 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX4Q12846 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX4Q12846 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STX4Q12846 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX4Q12846 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
STX4Q12846 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX4Q12846 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX4Q12846 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX4Q12846 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX4Q12846 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX4Q12846 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX4Q12846 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX4Q12846 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX4Q12846 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX4Q12846 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX4Q12846 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX4Q12846 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX4Q12846 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX4Q12846 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX4Q12846 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX4Q12846 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX4Q12846 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX4Q12846 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
STX4Q12846 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX4Q12846 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX4Q12846 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX4Q12846 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX4Q12846 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STX4Q12846 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STX4Q12846 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STX4Q12846 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STX4Q12846 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STX4Q12846 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STX4Q12846 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STX4Q12846 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STX4Q12846 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STX4Q12846 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STX4Q12846 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STX4Q12846 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STX4Q12846 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STX4Q12846 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STX4Q12846 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STX4Q12846 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STX4Q12846 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STX4Q12846 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STX4Q12846 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STX4Q12846 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STX4Q12846 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STX4Q12846 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STX4Q12846 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STX4Q12846 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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STX4Q12846 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STX4Q12846 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STX4Q12846 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STX4Q12846 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
STX4Q12846 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STX4Q12846 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STX4Q12846 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STX4Q12846 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STX4Q12846 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
STX4Q12846 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
STX4Q12846 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
STX4Q12846 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STX4Q12846 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
STX4Q12846 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STX4Q12846 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STX4Q12846 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STX4Q12846 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STX4Q12846 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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STX4Q12846 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STX4Q12846 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STX4Q12846 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STX4Q12846 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STX4Q12846 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STX4Q12846 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STX4Q12846 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STX4Q12846 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STX4Q12846 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STX4Q12846 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STX4Q12846 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STX4Q12846 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STX4Q12846 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STX4Q12846 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STX4Q12846 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STX4Q12846 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STX4Q12846 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
STX4Q12846 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STX4Q12846 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STX4Q12846 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
STX4Q12846 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STX4Q12846 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
STX4Q12846 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
STX4Q12846 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
STX4Q12846 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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