Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXO1Q12778 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXO1Q12778 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms