Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

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Length 1,597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ARHGEF5Q12774 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ARHGEF5Q12774 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ARHGEF5Q12774 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ARHGEF5Q12774 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ARHGEF5Q12774 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ARHGEF5Q12774 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGEF5Q12774 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGEF5Q12774 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGEF5Q12774 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGEF5Q12774 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGEF5Q12774 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGEF5Q12774 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGEF5Q12774 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGEF5Q12774 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGEF5Q12774 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGEF5Q12774 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARHGEF5Q12774 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARHGEF5Q12774 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARHGEF5Q12774 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARHGEF5Q12774 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARHGEF5Q12774 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARHGEF5Q12774 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
ARHGEF5Q12774 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARHGEF5Q12774 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF5Q12774 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
ARHGEF5Q12774 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
ARHGEF5Q12774 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ARHGEF5Q12774 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ARHGEF5Q12774 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
ARHGEF5Q12774 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ARHGEF5Q12774 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARHGEF5Q12774 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARHGEF5Q12774 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARHGEF5Q12774 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ARHGEF5Q12774 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ARHGEF5Q12774 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ARHGEF5Q12774 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ARHGEF5Q12774 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ARHGEF5Q12774 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
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