Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACSM1Q08AH1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms