Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF4Q08170 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF4Q08170 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms