Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL18Q07020 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL18Q07020 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RPL18Q07020 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RPL18Q07020 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL18Q07020 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL18Q07020 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL18Q07020 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms