Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHRNDQ07001 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHRNDQ07001 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNDQ07001 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms