Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DEUP1Q05D60 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DEUP1Q05D60 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEUP1Q05D60 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms