Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EGR4Q05215 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EGR4Q05215 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms