Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD164Q04900 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD164Q04900 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD164Q04900 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD164Q04900 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CD164Q04900 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CD164Q04900 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CD164Q04900 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CD164Q04900 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CD164Q04900 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CD164Q04900 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CD164Q04900 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CD164Q04900 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CD164Q04900 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CD164Q04900 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CD164Q04900 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CD164Q04900 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CD164Q04900 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CD164Q04900 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CD164Q04900 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CD164Q04900 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CD164Q04900 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CD164Q04900 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CD164Q04900 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CD164Q04900 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CD164Q04900 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CD164Q04900 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CD164Q04900 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CD164Q04900 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CD164Q04900 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CD164Q04900 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CD164Q04900 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CD164Q04900 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CD164Q04900 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CD164Q04900 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CD164Q04900 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CD164Q04900 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CD164Q04900 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CD164Q04900 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CD164Q04900 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CD164Q04900 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CD164Q04900 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CD164Q04900 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CD164Q04900 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CD164Q04900 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CD164Q04900 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CD164Q04900 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CD164Q04900 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CD164Q04900 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CD164Q04900 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CD164Q04900 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CD164Q04900 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CD164Q04900 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CD164Q04900 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CD164Q04900 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CD164Q04900 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CD164Q04900 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CD164Q04900 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CD164Q04900 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CD164Q04900 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CD164Q04900 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CD164Q04900 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CD164Q04900 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CD164Q04900 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CD164Q04900 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CD164Q04900 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CD164Q04900 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CD164Q04900 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD164Q04900 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD164Q04900 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD164Q04900 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD164Q04900 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD164Q04900 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD164Q04900 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD164Q04900 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD164Q04900 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD164Q04900 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD164Q04900 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD164Q04900 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CD164Q04900 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD164Q04900 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD164Q04900 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD164Q04900 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD164Q04900 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD164Q04900 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD164Q04900 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD164Q04900 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD164Q04900 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD164Q04900 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD164Q04900 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD164Q04900 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD164Q04900 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD164Q04900 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD164Q04900 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD164Q04900 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD164Q04900 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD164Q04900 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD164Q04900 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CD164Q04900 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD164Q04900 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms