Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RELAQ04206 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RELAQ04206 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RELAQ04206 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RELAQ04206 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RELAQ04206 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RELAQ04206 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RELAQ04206 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RELAQ04206 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RELAQ04206 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RELAQ04206 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RELAQ04206 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RELAQ04206 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RELAQ04206 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RELAQ04206 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RELAQ04206 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RELAQ04206 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RELAQ04206 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RELAQ04206 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RELAQ04206 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RELAQ04206 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RELAQ04206 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RELAQ04206 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RELAQ04206 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RELAQ04206 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RELAQ04206 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RELAQ04206 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RELAQ04206 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RELAQ04206 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RELAQ04206 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RELAQ04206 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RELAQ04206 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RELAQ04206 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RELAQ04206 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RELAQ04206 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RELAQ04206 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RELAQ04206 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RELAQ04206 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RELAQ04206 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RELAQ04206 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RELAQ04206 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RELAQ04206 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RELAQ04206 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RELAQ04206 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RELAQ04206 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RELAQ04206 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RELAQ04206 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RELAQ04206 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RELAQ04206 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RELAQ04206 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RELAQ04206 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RELAQ04206 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RELAQ04206 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RELAQ04206 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RELAQ04206 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RELAQ04206 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RELAQ04206 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RELAQ04206 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RELAQ04206 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RELAQ04206 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RELAQ04206 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RELAQ04206 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RELAQ04206 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RELAQ04206 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RELAQ04206 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RELAQ04206 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RELAQ04206 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RELAQ04206 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RELAQ04206 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RELAQ04206 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RELAQ04206 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RELAQ04206 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RELAQ04206 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RELAQ04206 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RELAQ04206 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RELAQ04206 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RELAQ04206 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RELAQ04206 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RELAQ04206 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RELAQ04206 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RELAQ04206 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RELAQ04206 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RELAQ04206 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RELAQ04206 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RELAQ04206 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RELAQ04206 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RELAQ04206 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RELAQ04206 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RELAQ04206 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RELAQ04206 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RELAQ04206 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RELAQ04206 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RELAQ04206 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RELAQ04206 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RELAQ04206 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RELAQ04206 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RELAQ04206 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RELAQ04206 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RELAQ04206 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RELAQ04206 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms