Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms