Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNT1Q02742 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms