Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP27A1Q02318 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP27A1Q02318 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP27A1Q02318 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP27A1Q02318 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP27A1Q02318 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP27A1Q02318 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP27A1Q02318 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP27A1Q02318 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP27A1Q02318 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP27A1Q02318 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP27A1Q02318 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP27A1Q02318 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP27A1Q02318 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP27A1Q02318 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP27A1Q02318 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP27A1Q02318 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP27A1Q02318 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP27A1Q02318 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP27A1Q02318 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP27A1Q02318 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP27A1Q02318 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms