Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC6A3Q01959 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A3Q01959 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms