Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms