Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRCDQ00LT1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms