Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VLDLRP98155 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms