Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SKOR1P84550 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms