Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBP5P82980 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBP5P82980 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBP5P82980 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBP5P82980 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBP5P82980 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBP5P82980 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RBP5P82980 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBP5P82980 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBP5P82980 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBP5P82980 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBP5P82980 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBP5P82980 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBP5P82980 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBP5P82980 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBP5P82980 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBP5P82980 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBP5P82980 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBP5P82980 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBP5P82980 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBP5P82980 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBP5P82980 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBP5P82980 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBP5P82980 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBP5P82980 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBP5P82980 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBP5P82980 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBP5P82980 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RBP5P82980 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBP5P82980 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBP5P82980 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBP5P82980 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBP5P82980 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBP5P82980 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBP5P82980 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBP5P82980 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBP5P82980 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBP5P82980 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBP5P82980 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBP5P82980 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBP5P82980 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBP5P82980 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBP5P82980 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBP5P82980 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBP5P82980 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBP5P82980 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBP5P82980 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBP5P82980 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBP5P82980 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBP5P82980 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBP5P82980 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBP5P82980 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBP5P82980 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RBP5P82980 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBP5P82980 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBP5P82980 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBP5P82980 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBP5P82980 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBP5P82980 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBP5P82980 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBP5P82980 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBP5P82980 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBP5P82980 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBP5P82980 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBP5P82980 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBP5P82980 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBP5P82980 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBP5P82980 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBP5P82980 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBP5P82980 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBP5P82980 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBP5P82980 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBP5P82980 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBP5P82980 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBP5P82980 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBP5P82980 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RBP5P82980 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RBP5P82980 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBP5P82980 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBP5P82980 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBP5P82980 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP5P82980 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP5P82980 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP5P82980 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP5P82980 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP5P82980 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP5P82980 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP5P82980 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP5P82980 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP5P82980 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP5P82980 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP5P82980 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP5P82980 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP5P82980 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP5P82980 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP5P82980 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP5P82980 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP5P82980 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP5P82980 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP5P82980 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms