Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX3P78415 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX3P78415 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX3P78415 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX3P78415 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
IRX3P78415 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
IRX3P78415 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
IRX3P78415 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRX3P78415 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRX3P78415 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRX3P78415 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRX3P78415 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRX3P78415 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRX3P78415 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRX3P78415 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
IRX3P78415 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27■■□□□ 1.91
IRX3P78415 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IRX3P78415 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IRX3P78415 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IRX3P78415 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
IRX3P78415 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRX3P78415 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRX3P78415 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRX3P78415 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRX3P78415 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRX3P78415 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRX3P78415 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRX3P78415 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRX3P78415 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX3P78415 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX3P78415 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX3P78415 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX3P78415 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX3P78415 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX3P78415 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX3P78415 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX3P78415 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX3P78415 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRX3P78415 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRX3P78415 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRX3P78415 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRX3P78415 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRX3P78415 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRX3P78415 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRX3P78415 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRX3P78415 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRX3P78415 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRX3P78415 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IRX3P78415 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
IRX3P78415 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
IRX3P78415 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
IRX3P78415 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRX3P78415 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRX3P78415 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRX3P78415 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRX3P78415 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRX3P78415 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRX3P78415 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRX3P78415 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRX3P78415 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRX3P78415 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRX3P78415 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRX3P78415 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX3P78415 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX3P78415 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX3P78415 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX3P78415 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX3P78415 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX3P78415 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX3P78415 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX3P78415 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX3P78415 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX3P78415 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX3P78415 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX3P78415 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX3P78415 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRX3P78415 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRX3P78415 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRX3P78415 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRX3P78415 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRX3P78415 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRX3P78415 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
IRX3P78415 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
IRX3P78415 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
IRX3P78415 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRX3P78415 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRX3P78415 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
IRX3P78415 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRX3P78415 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
IRX3P78415 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRX3P78415 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRX3P78415 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRX3P78415 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX3P78415 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX3P78415 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX3P78415 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX3P78415 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX3P78415 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX3P78415 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX3P78415 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms