Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX4P78413 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX4P78413 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX4P78413 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX4P78413 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX4P78413 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX4P78413 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX4P78413 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX4P78413 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX4P78413 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX4P78413 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX4P78413 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX4P78413 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX4P78413 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX4P78413 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX4P78413 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX4P78413 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX4P78413 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX4P78413 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX4P78413 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX4P78413 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX4P78413 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX4P78413 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX4P78413 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX4P78413 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX4P78413 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX4P78413 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX4P78413 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX4P78413 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX4P78413 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX4P78413 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX4P78413 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRX4P78413 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRX4P78413 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX4P78413 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX4P78413 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX4P78413 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX4P78413 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX4P78413 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX4P78413 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX4P78413 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX4P78413 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX4P78413 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX4P78413 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX4P78413 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX4P78413 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX4P78413 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX4P78413 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX4P78413 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX4P78413 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX4P78413 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX4P78413 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX4P78413 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX4P78413 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX4P78413 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX4P78413 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX4P78413 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX4P78413 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX4P78413 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX4P78413 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX4P78413 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX4P78413 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX4P78413 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX4P78413 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX4P78413 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX4P78413 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX4P78413 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX4P78413 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX4P78413 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX4P78413 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX4P78413 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX4P78413 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX4P78413 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX4P78413 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX4P78413 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX4P78413 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX4P78413 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX4P78413 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX4P78413 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX4P78413 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX4P78413 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX4P78413 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX4P78413 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX4P78413 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX4P78413 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX4P78413 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX4P78413 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX4P78413 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX4P78413 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX4P78413 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX4P78413 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX4P78413 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX4P78413 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX4P78413 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRX4P78413 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRX4P78413 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRX4P78413 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
IRX4P78413 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRX4P78413 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRX4P78413 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms