Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN10P78369 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN10P78369 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN10P78369 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN10P78369 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN10P78369 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN10P78369 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN10P78369 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN10P78369 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN10P78369 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN10P78369 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN10P78369 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLDN10P78369 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLDN10P78369 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLDN10P78369 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CLDN10P78369 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN10P78369 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN10P78369 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms