Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ASIC1P78348 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASIC1P78348 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms