Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPNP63162 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPNP63162 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms