Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL11P62913 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL11P62913 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL11P62913 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL11P62913 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL11P62913 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL11P62913 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL11P62913 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL11P62913 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL11P62913 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL11P62913 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL11P62913 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL11P62913 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL11P62913 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL11P62913 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL11P62913 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL11P62913 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL11P62913 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL11P62913 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL11P62913 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL11P62913 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL11P62913 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL11P62913 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL11P62913 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL11P62913 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL11P62913 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL11P62913 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL11P62913 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL11P62913 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL11P62913 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL11P62913 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL11P62913 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL11P62913 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL11P62913 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL11P62913 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL11P62913 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL11P62913 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL11P62913 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL11P62913 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL11P62913 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL11P62913 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL11P62913 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL11P62913 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL11P62913 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL11P62913 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL11P62913 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL11P62913 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL11P62913 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL11P62913 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL11P62913 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL11P62913 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL11P62913 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL11P62913 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL11P62913 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL11P62913 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL11P62913 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL11P62913 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL11P62913 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL11P62913 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL11P62913 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL11P62913 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL11P62913 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL11P62913 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL11P62913 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL11P62913 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL11P62913 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL11P62913 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL11P62913 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL11P62913 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL11P62913 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL11P62913 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL11P62913 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL11P62913 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL11P62913 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL11P62913 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL11P62913 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL11P62913 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL11P62913 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL11P62913 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL11P62913 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL11P62913 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL11P62913 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL11P62913 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL11P62913 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL11P62913 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL11P62913 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL11P62913 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL11P62913 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL11P62913 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL11P62913 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL11P62913 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL11P62913 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL11P62913 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL11P62913 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL11P62913 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL11P62913 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL11P62913 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL11P62913 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL11P62913 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL11P62913 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms