Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOBP62745 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOBP62745 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOBP62745 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOBP62745 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOBP62745 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOBP62745 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOBP62745 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOBP62745 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOBP62745 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOBP62745 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOBP62745 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOBP62745 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOBP62745 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOBP62745 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOBP62745 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOBP62745 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOBP62745 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOBP62745 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOBP62745 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOBP62745 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RHOBP62745 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RHOBP62745 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOBP62745 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOBP62745 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOBP62745 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOBP62745 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOBP62745 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOBP62745 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOBP62745 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOBP62745 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOBP62745 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOBP62745 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOBP62745 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOBP62745 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOBP62745 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOBP62745 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOBP62745 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOBP62745 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOBP62745 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOBP62745 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOBP62745 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOBP62745 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOBP62745 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOBP62745 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOBP62745 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOBP62745 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOBP62745 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOBP62745 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOBP62745 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOBP62745 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOBP62745 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOBP62745 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOBP62745 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOBP62745 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOBP62745 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOBP62745 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOBP62745 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOBP62745 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOBP62745 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOBP62745 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOBP62745 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOBP62745 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOBP62745 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOBP62745 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOBP62745 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOBP62745 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOBP62745 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOBP62745 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOBP62745 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOBP62745 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOBP62745 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOBP62745 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOBP62745 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOBP62745 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOBP62745 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOBP62745 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOBP62745 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOBP62745 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOBP62745 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOBP62745 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOBP62745 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOBP62745 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOBP62745 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOBP62745 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOBP62745 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOBP62745 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOBP62745 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOBP62745 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOBP62745 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOBP62745 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOBP62745 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOBP62745 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOBP62745 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOBP62745 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOBP62745 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOBP62745 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOBP62745 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RHOBP62745 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RHOBP62745 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms