Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPD2P62316 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNRPD2P62316 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms