Protein–RNA interactions for Protein: P61962

DCAF7, DDB1- and CUL4-associated factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF7P61962 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF7P61962 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF7P61962 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF7P61962 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF7P61962 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF7P61962 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF7P61962 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF7P61962 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF7P61962 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF7P61962 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF7P61962 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF7P61962 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF7P61962 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
DCAF7P61962 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF7P61962 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms