Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVK-16P61578 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVK-16P61578 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVK-16P61578 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-16P61578 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-16P61578 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-16P61578 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-16P61578 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-16P61578 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-16P61578 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-16P61578 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-16P61578 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-16P61578 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERVK-16P61578 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVK-16P61578 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVK-16P61578 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVK-16P61578 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVK-16P61578 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVK-16P61578 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVK-16P61578 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVK-16P61578 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVK-16P61578 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVK-16P61578 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVK-16P61578 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVK-16P61578 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVK-16P61578 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVK-16P61578 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVK-16P61578 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVK-16P61578 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVK-16P61578 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVK-16P61578 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVK-16P61578 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVK-16P61578 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVK-16P61578 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVK-16P61578 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVK-16P61578 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVK-16P61578 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVK-16P61578 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVK-16P61578 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVK-16P61578 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms